SARS-CoV-2 PCR-Test von Alpha bis Omikron

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Frankfurt am Main, 08.12.2021.

Neuer Corona-PCR-Test bestimmt Omicron- oder Delta-Variante sofort mit

Bild1_GenXPro_VarXcreen_Test_X_Serielle Analyse.png — Vergleich des Ablaufs herkömmliche vs. GenXPro-VoXcreen Analyse / Bildrechte GenXPro GmbH

Zwei auf einen Streich: Die Biotech Firma GenXPro hat einen neuartigen PCR-Test entwickelt, der im ersten Schritt des Screening-Tests zugleich die Omicron- und Delta-Variante miterkennt.

Dieser neue Coronatest spart wertvolle Zeit und schont die aktuell kostbare Laborkapazität. Die Firma GenXPro GmbH aus Frankfurt hat einen PCR-Test entwickelt, der neben der Bestimmung des Vorliegens einer SARS-CoV-2 Infektion gleichzeitig eindeutig miterkennt, ob es sich um die neue Omicron- oder die Delta-Variante handelt. Beide Varianten machen zusammen nahezu 100% aller aktuell in Deutschland verbreiteten SARS-CoV-2 Viren aus.

Der neue „VoXcreen“-Test ermöglicht, das bisher übliche zeitraubende Mehr-Stufen-Prinzip zur Variantenerkennung einzusparen, da die zusätzlichen Tests zur Bestimmung der Varianten in den Laboren wegfallen (siehe Bild 1 und Bild 2 (unten)). Der neue Test wurde von verschiedenen Diagnoselaboren geprüft und es werden bereits ca. 15.000 Proben pro Woche mit dem Test untersucht.

Bisher müssen Testlabore zur Bestimmung der Corona-Virusvarianten nach dem Test auf SARS-CoV-2 (=Screening Test) zusätzliche PCR-Tests zur Bestimmung der SARS-CoV-2-Virusvarianten durchführen. Danach erfolgt zur sicheren Bestimmung von Omicron aktuell noch eine Sequenzierung.

Hierzu müssen die positiven Proben aus einer Vielzahl an Proben herausgesucht werden (von Hand) und erneut untersucht werden. Hierbiei kann es leicht zu Verwechslungen der Proben kommen. Insgesamt dauert die Analyse bis zu vierzehn Tage. Zeit, die für die Nachverfolgung der Verbreitung der Varianten und zur Therapieoptimierung fehlt. Mit dem neuen PCR-Test von GenXPro kann bereits mit dem ersten PCR-Test (Screening-Test) die Omicron- und Delta-Variante eindeutig identifiziert werden. Bereits nach ca. 1,5 Stunden erfährt man so, ob eine SARS-CoV-2 Infektion vorliegt und auch gleich welche Variante dafür verantwortlich ist. Hierdurch werden dringend benötigte PCR-Kapazitäten in den Laboren frei, die aktuell für die zusätzlichen PCRs zur Variantenerkennung benötigt werden. Da eine Therapie mit monoklonalen Antikörpern bei Omikron kaum funkttioniert, ist eine schnelle Erkennung der Varianten wichtig für die Therapieentscheidung (siehe https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.07.470392v1)

Der neue Test der Frankfurter Firma GenXPro erkennt als allgemeinen Nachweis von SARS-CoV-2 zum einen eine Stelle im Genom des Virus die in allen SARS-CoV-2 Viren vorkommt. Zusätzlich erkennt er eine Lücke im Genom des Virus (Deletion), die nur in der Omicron Variante vorkommt. Die Delta-Variante wird anhand einer anderen Deletion ebenfalls eindeutig erkannt. Dadurch wird jede der beiden Varianten an zwei Stellen im Genom nachgewiesen. Dieses „Dual Target“ Prinzip bietet eine erhöhte Sicherheit bei der Diagnostik. Bereits nach der ersten PCR wird klar, um welche der beiden in Deutschland zu fast 100% vertretenen „Variants of Concern“ (VOC) es sich handelt (siehe Bild 2).

Sollte es sich um eine der inzwischen sehr seltenen anderen Varianten handeln, schlägt nur der allgemeine SARS-CoV-2 Nachweis an.

Mehr Information dazu finden Sie unter: https://genxpro.net/omikron-pcr-test/ oder https://genxpro.net/sars-cov-2-omicron-pcr-test/

Press Release

Frankfurt am Main, 08.12.2021

New Covid-PCR-Test determines the Omicron or Delta variant immediately for a fast therapeutic decision and to free PCR capacities

Comparison of the process conventional vs. GenXPro-VoXcreen analysis / Image rights GenXPro GmbH

Two in one go: The biotech company GenXPro has developed a new type of PCR test that detects the Omicron and Delta variants during the screening PCR for Covid-19 / SARS-CoV-2

This new corona test saves valuable time and liberates the currently valuable laboratory capacity. The company GenXPro GmbH (Frankfurt, Germany) has developed a PCR test which, in addition to determining the presence of a SARS-CoV-2 infection, also clearly recognizes whether it is the new Omicron or the Delta variant. Both variants together make up almost 100% of all SARS-CoV-2 viruses currently widespread in almost all countries in the world. The new “VoXcreen” test makes it possible to save the previously time-consuming multi-stage principle for variant recognition, as the additional tests to determine the variant in the laboratories are no longer necessary (see Figure 1 and Figure 2 (below)) ). The new test has been validated by various diagnostic laboratories and several 10thousands of samples are already examined with the test every week.

So far, test laboratories have to carry out additional PCR tests to determine the SARS-CoV-2 virus variants to determine the corona virus variants after the test for SARS-CoV-2 (= screening test). After that, sequencing is currently carried out for the reliable determination of Omicron. To do this, the positive samples must be selected (by hand) from a large number of samples in the freezers and re-examined. This can easily lead to mix-ups of the samples. The analysis takes up to fourteen days in total. Time that is missing for tracking the distribution of the variants and for optimizing therapy. With the new PCR test from GenXPro, the Omicron and Delta variants can be clearly identified with the first PCR test (screening test). After about 1,5 hours you can find out whether there is a SARS-CoV-2 infection and which variant is responsible for it. This frees up urgently needed PCR capacities in the laboratories that are currently required for the additional PCRs for variant recognition. Since a therapy with monoclonal antibodies hardly works with Omicron, a quick identification of the variants is important for the therapy decision (see https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.07.470392v1).

The new test from the Frankfurt-based company GenXPro recognizes, as general detection of SARS-CoV-2, a site in the genome of the virus that occurs in all SARS-CoV-2 viruses. In addition, it recognizes specifically a gap in the genome of the virus (deletion) that only occurs in the Omicron variant. The delta variant is also clearly recognized on the basis of another deletion. As a result, each of the two variants is detected at two locations in the genome. This “dual target” principle offers increased reliability in diagnostics. If one of the meanwhile very rare other variants is analyzed, only the general SARS-CoV-2 detection is effective.

Further Information: https://genxpro.net/sars-cov-2-omicron-pcr-test/

Frankfurt am Main, 31.08.2021.

Die ursprüngliche Virusvariante von SARS-CoV-2 spielt im Infektionsgeschehen weltweit fast keine Rolle mehr, da die ansteckenderen und oft auch mit schwererem Krankheitsverlauf einhergehenden Varianten ALPHA, BETA, GAMMA und DELTA sich durchgesetzt haben.

Um zu verstehen, wie sich diese „Variants of Concern“ verbreiten und um gezielt Gegenmaßnahmen zu ergreifen, müssen die einzelnen Varianten schnell erkannt werden. Dies gilt insbesondere für die Delta Variante, die bisher als ansteckendste Variante gilt und noch mehr schwere Verläufe der Covid-19 Erkrankung hervorruft als noch bis Juni in Deutschland verbreitete Alpha Variante. Alle Varianten tragen spezielle Mutationen, die für die gefährlicheren Eigenschaften verantwortlich sind.

In Deutschland und in Europa sowie in den USA sind inzwischen fast ausschließlich die besonders ansteckenden Variante DELTA und einige ALPHA verbreitet.

Das Biotech Unternehmen GenXPro aus Frankfurt am Main hat jetzt ein PCR Testkit entwickelt, mit welchen neben der Erkennung von SARS-CoV-2, gleichzeitig die beiden Hauptvarianten ALPHA und DELTA erfasst werden. Somit kann für >99 % aller SARS-CoV-2 Positiven mit einem einzelnen PCR Test auch die Variante bestimmt werden. Aktuell werden hierfür mindestens zwei PCR Analysen benötigt.

Für eine sichere Diagnose muss das Virus anhand von zwei Nachweisen erkannt werden, („Dual Target“), zudem muss eine interne Kontrolle den Test begleiten.

Der neue „Alpha-Delta-Screening Assay” der GenXPro GmbH erfüllt als aktuell einziger Test diese Voraussetzungen auch für die gleichzeitige Erfassung der beiden Hauptvarianten.

Dank des neuen Tests können die im Moment noch notwendigen zusätzlichen PCR Tests zur Bestimmung der Varianten eingespart werden und die Kosten für die Analysen reduziert werden.

Zudem wurde ein weiterer Tests entwickelt, mit welchem alle vier „Variants of Concern“ ALPHA, BETA, GAMMA und DELTA in einer einzelnen PCR unterschieden werden, bisher sind hierfür vier unterschiedliche PCR Tests notwendig.

Einige Laborärzte nutzen das Kit nach intensiver Prüfung bereits. Aktuell arbeitet das GenXPro Team mit der Firma InnoTrain aus dem Hessischen Kronberg auch an einer CE-Zertifizierung.

Um auch zukünftige Varianten untersuchen zu können haben die Frankfurter auch PCR Tests für die Lambda und Kappa Variante sowie für weitere Mutationen des Virus entwickelt.

Weitere Informationen (auf Englisch) unter: https://genxpro.net/sars-cov-2-qpcr-assays-2/

Über GenXPro

Die GenXPro GmbH aus Frankfurt am Main ist spezialisiert auf RNA- und DNA-Analysen und bietet Service und Produkte für Hochdurchsatzsequenzierung an, die zur Forschung und insbesondere zur optimierten Behandlung von Krebs genutzt werden. Aufgrund der SARS-CoV-2 Pandemie haben sie Ihre Expertise im Bereich quantitativer PCR und Gensequenzierung zur Entwicklung von Produkten und Service zur Eindämmung der Covid-19 Pandemie eingesetzt.